Incluso en el último drama de duelo, "La Guerra de la Copa Santa", el mago Kiritsugu Emiya, que no elige ningún medio,y el espíritu de Saber, que se apega a su caballerosidad, se deciden. Era un objetivo. Las sombras de Kirei Kotomine, un buscador de la iglesia que se encuentra misteriosamente frente a Kirei, y los muchos espíritus que atacan a los dos que tienen disonancia, esta es la historia que nos lleva al principio.